Second House（セカンドハウス）
“生き抜くチカラを育むこと”を重視。フリースペースでの自由な過ごし方、学習支援、体験学習、ワークショップを提供。
学び舎あとらぼ（熊本サドベリースクール）
サドベリースクール方式のオルタナティブスクール／フリースクール。ミーティング（会議）で運営方針を決め、遊びを学びと捉え、自由参加型ワークショップや水曜の外出活動（そとらぼ・ここらぼ）を行う。2025年秋に新しいフリースクールへ生まれ変わり。運営者：山田朋和。
八洲学園中等部 堺本校
自学自習しやすい落ち着いた環境を提供し、多くのイベントと多様な体験学習が特徴。高校生との交流機会もあり、高校進学へのイメージ形成をサポートする。
セイカ学園中等部 京都伏見校
安心して登校できる居場所を提供するフリースクール。連携高校（鹿島朝日・鹿島学園高校、精華学園高等学校）により高校卒業までの将来像が描ける。
鳥居イングリッシュスクール（HSC対応リベラルスクール）
HSC（ひといちばい敏感な子）に対応した自宅フリースクール・リベラルスクール。落ち着いた優しい子たちが集う小さな居場所。英語×共創の学び×自分軸コーチングを大切にし、ティータイム・外遊び・料理・アート・音楽・茶道や海合宿・校外体験も。月・水・金開所、船橋駅すぐ。千葉県サポートガイド／船橋市不登校相談リーフレットの「民間フリースクール等一覧」に掲載。
みんなの居場所あめつち
岐阜県各務原市のオルタナティブスクール（フリースクール）／自然保育園。學び舎いっぷう（6〜15歳）、自然保育やまびこ（満3〜6歳）、親子組まめっこ（0〜6歳）を運営。
不登校子ども支援の会 ハルーノ
不登校や発達障害の子どもの進学、引きこもりの社会復帰の実績を掲げる不登校子ども支援の会。発達障害・学習障害・起立性調節障害・不安障害への対応実績あり。
特定非営利活動法人 青少年自立援助センターブルーム（NPO法人bloom）
ひきこもり・不登校・障がい児者・非行・ニート・若年無業者等を対象に自立援助・自立支援を実施。
NPO法人 箱崎自由学舎ESPERANZA（エスペランサ）
不登校・ひきこもり・進学/中退でお悩みの方を対象にした福岡市のフリースクール。教科指導、農業体験、料理教室、陶芸体験など多彩な活動を実施する。
フリースクール たね（憩いのまなび家イロトリドリ／お山の会）
大人も子どもも素のままでいられる場所。学校の代わりではなく、日々の実体験から自分の人生をデザインし、生きる力を身につけていく。自分の「違い」を認め合える環境。
