みらいゲート秋葉原
学研グループが運営する小学生専門のフリースクール。不登校の子どもに安心できる居場所と個別最適な学習サポートを提供する。復学率約60%、スタッフの信頼度100%を掲げる。秋葉原・神田エリアに立地。
一般社団法人うみのこてらす（海部拠点「われもこう」）
どこに生まれても、どんな環境で育っても、あたたかなつながりの中で安心して育ち・学び、自分らしく人生を歩めるよう支援する。
NPO法人 フリースクール・オンリーワン
不登校や行き渋りの児童生徒、他校在籍の高校生、高卒後の就職不安者も利用可。発達特性やメンタル状況に応じたサポート体制あり。併設の通信制高校で高卒資格取得も可能。
家庭塾のミライ
学習塾から相模原市に誕生したフリースクール。不登校の子の居場所づくりと保護者カウンセリングに特化し、親子で一緒に変わることを重視。
ふりーすくーる ぼうけん のがり山
自然いっぱいの冒険遊び場を中心としたデモクラティックスクール型フリースクール。子どもが興味から学ぶ環境を提供。「自分でやりたいことを見つける→調べる→考える→解決する」を実践。
志塾フリースクール ラシーナ泉北教室
大阪府堺市を中心にフリースクールや地域交流拠点を展開。不登校の子どもが安心して過ごせる居場所・学びの場を提供し、学習支援や居場所づくりを通じて自ら学ぶ力を育む。
さくら国際高等学校 中学生フリースクール
フォスターアカデミーが運営する、さくら国際高等学校の学習センターに集う生徒と交流しながら学べる学び舎（中学生フリースクール／通信制高校を併設案内）。仲間との学習を通じて多様な価値観を知り、主体性とコミュニケーション能力を養う。
フリースクール みらいの学び
学校に通っていないが勉強したい子のための京都・向日市のフリースクール。将来の可能性を失わないことを目指す。2023年4月開校。
不登校等の親の会「いなほ」
学校へ行きにくい子どもの親の会として2005年に発足した会。月に1回ほど活動。
むこうフリースペース sugoshiba（すごしば）
中高生世代の「発達する権利」「休み・遊ぶ権利」を保障するフリースペース。Nintendo Switch、本・マンガ・アニメ、アナログゲーム、学習部屋、WiFi、隣接の公園などがあり、お菓子とジュースは無料。