まなびスペースCOCOCARA
NPO法人COCO.NETが運営する小学1年生～高校生対象のフリースクール(まなびスペースCOCOCARA)。義務教育段階の不登校の子どもの学びと育ちの場として運営し、ウエルビーイング教育を実践する。令和8年度千葉市の不登校児童生徒学習支援・フリースクール連携事業の委託団体。
NEXTAGE SCHOOL（ネクステージスクール）桐生
独自カリキュラムを採用したオルタナティブスクール。学習塾とフリースクールの機能を兼ね備えた少数精鋭の学びの場。
志塾フリースクール LINO
学校に行けない・行かない選択をした時に学びを諦めず、様々な体験や学びを通してひとりひとりの自立・将来につなげる居場所。
富士・富士宮不登校ホームスクール親の会 ゆるりと
富士市を中心とした、発達が気になる子・登校登園渋り・敏感さん・不登校・ホームスクーラーのおしゃべりデイ（親の会）。支援者や地域の方も参加可。
中津川市民立小中一貫校 花咲学園
教育機会確保法に基づくフルタイムのフリースクール。2022年7月にプレ開校し週1回から開始、2023年4月に週4日で本格開校。定員20名程度。
オーレスコーレ
小平市の医療連携型フリースクール。医療的サポートを受けながら子どもごとに寄り添い、学習だけでなく体験学習を通じて発達に寄り添い、家族・先生・地域とのつながりを育む。
きみの森 〜平日お昼の子どもの居場所〜
平日昼間に不登校の子どもたちが過ごせる居場所。子どもも保護者も気兼ねなく過ごせる場を提供。
フリースクール ネモ市川（NPO法人ネモ）
NPO法人ネモネット運営の子ども・若者の居場所。小中高生を中心に20〜30代も利用。決まった時間割やプログラムはほぼなく、月数回のミーティングで活動を決め、自由に過ごせる。
認定NPO法人 夢街道国際交流子ども館
京都府木津川市でフリースクールを運営する認定NPO法人。不登校や引きこもり経験など様々な背景を持つ小学4年生から高校生を対象に、「信じる・待つ・愛する」をモットーに子どもが素顔のまま過ごせる場所を提供する。
みんなの秘密基地（特定非営利活動法人みんなの）
北海道砂川市のNPOが運営する子ども・若者の無料の居場所。不登校支援/フリースクール、放課後ユースセンター、土曜ユースセンター＆子ども食堂、大人向け茶会などを実施。
