学び舎あとらぼ（熊本サドベリースクール）
サドベリースクール方式のオルタナティブスクール／フリースクール。ミーティング（会議）で運営方針を決め、遊びを学びと捉え、自由参加型ワークショップや水曜の外出活動（そとらぼ・ここらぼ）を行う。2025年秋に新しいフリースクールへ生まれ変わり。運営者：山田朋和。
きみの森 〜平日お昼の子どもの居場所〜
平日昼間に不登校の子どもたちが過ごせる居場所。子どもも保護者も気兼ねなく過ごせる場を提供。
フリースクール SEIBISPACE 神栖（成美学園グループ）
夢を見つけたい・挑戦したい生徒をサポート。各生徒に専任コーチがつき学習・コミュニケーション・時間管理を支援。午後は独自カリキュラム「夢授業」を実施。
NIJINアカデミー 諏訪校
NIJINアカデミーの諏訪校（諏訪市）。オンライン（メタバース）とリアル教室を組み合わせた小中高一貫のオルタナティブスクール。少人数で自分のペースで学べ、在籍校での出席扱い実績あり。発達特性への配慮も。
よりみちステーション
武雄市で子どもや若者が安心して自分らしく暮らせるように、地域のいろんな人たちがごちゃ混ぜにふれあう居場所づくりに取り組んでいる。
フリースクール Bamboo（バンブー）
横浜市港北区のバンブーまなび塾が運営。高卒認定や学童保育の案内あり（詳細な活動内容の記載は乏しい）。
NIJINアカデミー 二子玉川校
NIJINアカデミーの二子玉川校（世田谷区）。オンライン（メタバース）とリアル教室を組み合わせた小中高一貫のオルタナティブスクール。少人数で自分のペースで学べ、在籍校での出席扱い実績あり。発達特性への配慮も。
NPO法人 フリースクール興学社
松戸市のフリースクール。「自分が本当にやりたいコト」を見つけるため様々なことにチャレンジし、夢や目標を発見して協力者とともにかなえていく支援を行う。
東京シューレ流山
不登校の子どもが安心して過ごせる、6歳からのフリースクール。安心した環境の中でやりたいことが生まれ、自信や自己肯定感につながることを支援する。通信制高校コースの利用も可能。
ミチル国際学院
学校に行けない・行きたくない児童生徒の居場所。自分のペースで自分らしく学べるフリースクール。
