不登校・中退専門塾「キズキ共育塾」（オンライン）
不登校・中退・通信制高校からの受験に対応する完全個別指導塾。14,000人以上の卒業生実績を持ち、小学生から社会人まで対象。心身の不調と学びの継続を並行してサポートする。
Free School YADOLI
「日本初 医療従事者が集うフリースクール」。専門職が最大限のスキルで子どもを支援する。2023年に堺市で開校。
フリースクール 日なた（NPO法人ぱーむぼいす運営）
長野県北信地域で、学校生活や社会生活になじめない・抵抗感を感じる青少年やその保護者を支援するNPO法人。カウンセリング、小中学生の学習支援、居場所支援「日なた」、高校生の学習・生活支援、就労準備支援などを行う。居場所「日なた」は2024年に信州型フリースクールに認定。
NIJINアカデミー 大阪吹田校
NIJINアカデミーの大阪吹田校（吹田市）。オンライン（メタバース）とリアル教室を組み合わせた小中高一貫のオルタナティブスクール。少人数で自分のペースで学べ、在籍校での出席扱い実績あり。発達特性への配慮も。
自分いろさがし虹いろ広場
広島県呉市の小学1～6年の不登校児や学校教育に適応しづらい子に、一人一人に応じた学習内容を提供するフリースクール。
miniPlusフリースクール（一般社団法人アイネット）
一般社団法人アイネットが運営。フリースクール（予習・復習、テスト対策、季節イベント、遠足、部活）、パソコンスクール、カウンセリング、クラフト教室、日商PC試験会場を運営。
ボドゲステーション（フリースクール）
プログラミングやボードゲーム、3Dプリンターなどを活用した学習環境を提供するフリースクール。強制せず子どもの興味や個性を大切にし、自分のペースで安心して学べる教育方針を特徴とする。習志野駅前に立地。
おどりばスクール
「安心していられる場所」を大切にし多様性を受け入れる居場所。学校以外の学びの場を提供。
あだちファミリースペース every tree
足立区のフリースクール。不登校の子が安心して過ごせる居場所で、読書や手芸・図工など好きなことを選べ「何もしない」ことも可能。多世代交流を通じ子どもが希望を持てる環境を提供。
ふれあい広場サテライト
不登校・中退などで居場所を必要とする子ども・若者が、同年代の仲間と安心して過ごせる居場所（アスイク）。
