ハレとケ
茨城県坂東市にある、地域の人が「食」を通してつながれるみんなの居場所。不登校生も対象。食体験イベント、畑仕事、居場所提供、子どもが作る食堂、おもちゃライブラリー、季節のてしごと等を実施。
特定非営利活動法人 青少年自立援助センターブルーム（NPO法人bloom）
ひきこもり・不登校・障がい児者・非行・ニート・若年無業者等を対象に自立援助・自立支援を実施。
NPO法人 こどもの新しい居場所 えーぽいんと
こどもの居場所。自発的な行動を尊重しながら、保護者と一緒に各々のゴールを更新し社会と繋ぐ支援を行う。
クラーク国際中等部 札幌白石キャンパス
クラーク国際中等部の札幌白石キャンパス（札幌市白石区）。在籍校に籍を置いたまま通える中等部で小6〜中3が対象。全日型・週2通学・月1〜2通学＋オンラインから選べ、全教員が学習心理支援カウンセラー資格を保持。入学金30,000円／月22,700円〜。
クラーク国際中等部 福岡キャンパス
クラーク国際中等部の福岡キャンパス（福岡市中央区）。在籍校に籍を置いたまま通える中等部で小6〜中3が対象。全日型・週2通学・月1〜2通学＋オンラインから選べ、全教員が学習心理支援カウンセラー資格を保持。入学金30,000円／月22,700円〜。
フリースクールNOBINOBI
新潟市中央区のフリースクール。不登校や不登校ぎみの児童、発達凸凹の子どもを対象に、個別のペースに寄り添った学習支援と心理的安全性を重視した運営を行う。
中津川市民立小中一貫校 花咲学園
教育機会確保法に基づくフルタイムのフリースクール。2022年7月にプレ開校し週1回から開始、2023年4月に週4日で本格開校。定員20名程度。
NIJINアカデミー 千葉県東金校
発達障害・不登校の子ども向けフリースクール。平日はオンライン、土曜午前は定員5名のリアル教室で、作業療法士の教室長が一貫してサポートする。
フリースクールForLife（NPO法人ふぉーらいふ）
「自主」「自立(律)」「生活と命」を教育理念に体験型の学びを提供。1997年開校。
ひだまりスペース
不登校の子どもたちに安心できる居場所を提供し、「学校に行けていない今の自分でもいいよね」と思える環境を創出するフリースクール。NPO法人わこうフードネットワークの事業の一つ。勇気づけと共感を基本方針とする。
