フリースクール ギフト
好きなことを見つけ、得意なことを伸ばし、自分を好きになることをお手伝いするフリースクール。合同会社ワールドブリッジ21が運営（松山市上一万）。
あかしフリースペース☆トロッコ
築100年のレトロな木造民家にある、明石市の6～18歳を対象としたフリースペース。子どもとスタッフが一緒に活動を決め、自分のペースで過ごせる。一般社団法人こっちが運営。
ハレとケ
茨城県坂東市にある、地域の人が「食」を通してつながれるみんなの居場所。不登校生も対象。食体験イベント、畑仕事、居場所提供、子どもが作る食堂、おもちゃライブラリー、季節のてしごと等を実施。
NPO法人 フリースクール・オンリーワン
不登校や行き渋りの児童生徒、他校在籍の高校生、高卒後の就職不安者も利用可。発達特性やメンタル状況に応じたサポート体制あり。併設の通信制高校で高卒資格取得も可能。
クラスジャパン
2018年開校の日本初のオンラインフリースクール（クラスジャパン小中学園）。担任による伴走支援とAI教材を提供し、在籍校と連携して出席扱い・成績評価に対応。eスポーツ・プログラミング・美術などのオンライン部活・HRあり。
別府フリースクールうかりゆハウス
フリースクール（不登校児童対象）、個別学習塾（外国籍児童・学習困難児向け）、こども哲学対話の3つの軸で運営。2022年4月開設。
小さなイエナスクール＠浦安
イエナプラン教育の理念に基づき、異年齢の子どもたちが共に遊び、協働・共生する学びの場。読書・ボードゲーム、自然での活動や科学館訪問などを実施。
枚方オルタナティブスクール「ひらたな」
京都教育大学で20年以上研究された探究学習を軸とした教育機関。柔軟な「個」を育成し、不登校児童の早期支援を目的とする。
おやこフリースクール
臨床心理士常駐のサポートのもと、傷ついた心を癒し人格の成長をメインテーマとするフリースクール。少人数限定。
FLEXIA（フレクシア）
1時間から利用できる完全チケット制のフリースクール。通い方・頻度・時間をすべて自由に選べ、不登校など学校以外の学びの場を必要とする子どもが家や学校の代わりに過ごせる場所。
