かさねテ 親子でかがやく不登校カフェ INふくやま
不登校で悩む当事者親子で参加できるカフェ。月1回の茶話会は時間内なら出入り自由。目指すのは再登校ではなく将来的な子どもの自立。
ito（いと）
不登校の小中学生を対象としたフリースクール。個性を尊重した学習環境で、体を動かしたり料理やゲームなど好きなことを実践。フリースペースも週1回程度開催し、相談も随時受け付ける。
別府フリースクールうかりゆハウス
フリースクール（不登校児童対象）、個別学習塾（外国籍児童・学習困難児向け）、こども哲学対話の3つの軸で運営。2022年4月開設。
八洲学園中等部 堺本校
自学自習しやすい落ち着いた環境を提供し、多くのイベントと多様な体験学習が特徴。高校生との交流機会もあり、高校進学へのイメージ形成をサポートする。
AOiスクール（小田急のオルタナティブスクール）
小田急電鉄が運営する、不登校の児童生徒向けのオルタナティブスクール。「好き」をきっかけにしたコミュニケーションや学びを届ける。ライブセミナーコース／バーチャルキャンパスコース／善行コースがある。東京都フリースクール等利用者支援事業（助成金）の認定施設。運営は不登校の原体験をもつ社員が企画。
フリースクール こうのとりの巣
松戸市の支援施設。不登校の再登校支援や出勤困難者の再出勤・再就職支援に特化し、対面・電話・カフェなど柔軟な形で教育相談支援の専門家がサポートする。
フリースクールせいよう
不登校の生徒・保護者に社会参画の機会を提供し自立した生活を支援する事業。学校復帰だけでなく多様な学びの場を提供する学習＆居場所支援。
フリースクール 日なた（NPO法人ぱーむぼいす運営）
長野県北信地域で、学校生活や社会生活になじめない・抵抗感を感じる青少年やその保護者を支援するNPO法人。カウンセリング、小中学生の学習支援、居場所支援「日なた」、高校生の学習・生活支援、就労準備支援などを行う。居場所「日なた」は2024年に信州型フリースクールに認定。
フリースクールたんぽぽ（NPO法人ハッピーラボ／金山・熱田から通学可）
NPO法人ハッピーラボ運営。時間割や登下校時間がなく個々のペースで学習。在籍校の出席扱い認定を受けており通学定期にも対応。教員免許保有スタッフ配置、クラス分けなしの子ども主体運営。
沖縄オルタナティブスクール らしく
気持ちをきくことから始まり、自己選択と自己決定を通じて、沖縄の自然環境を活かした学習を実践するオルタナティブスクール。
