豊川中央フリースクール
さくら国際高等学校の豊川市内唯一の指定認定校。不登校・ひきこもり・学力不振など様々な理由で高校に通えない人が安心して通える通信制高等学校。
居場所と学び舎 CLAST（クラスト）
「子どもが真ん中」の理念に基づき、主に不登校の子どもたちが利用する居場所。基礎学習と様々な体験を通じて自己理解を深め、心身ともに成長できる場を提供。学校と連携。通信制高校併設。
フリースクール Bamboo（バンブー）
横浜市港北区のバンブーまなび塾が運営。高卒認定や学童保育の案内あり（詳細な活動内容の記載は乏しい）。
フリースクール風多機能型事業所 キートス・ベース
多機能型事業（児童発達支援・放課後等デイサービス・不登校支援）を運営する多機能型放課後等デイサービス キートス・ベース。富士見学習センターあり。
クラーク国際中等部 立川キャンパス
クラーク国際中等部の立川キャンパス（立川市）。在籍校に籍を置いたまま通える中等部で小6〜中3が対象。全日型・週2通学・月1〜2通学＋オンラインから選べ、全教員が学習心理支援カウンセラー資格を保持。入学金30,000円／月22,700円〜。
フリースクール リフレルーム（NPO法人）
学校に行くことに躊躇いを感じている、または不登校の中学生を対象としたフリースクール。自己肯定感やコミュニケーション力の向上、社会的自立を重点に、各自のペースで学習や興味ある活動に取り組める。
フリースクール ギフト
好きなことを見つけ、得意なことを伸ばし、自分を好きになることをお手伝いするフリースクール。合同会社ワールドブリッジ21が運営（松山市上一万）。
別府フリースクールうかりゆハウス
フリースクール（不登校児童対象）、個別学習塾（外国籍児童・学習困難児向け）、こども哲学対話の3つの軸で運営。2022年4月開設。
miniPlusフリースクール（一般社団法人アイネット）
一般社団法人アイネットが運営。フリースクール（予習・復習、テスト対策、季節イベント、遠足、部活）、パソコンスクール、カウンセリング、クラフト教室、日商PC試験会場を運営。
フリースクール型放課後等デイサービス ふりーすてっぷ
加古川市初の不登校に特化したフリースクール型放課後等デイサービス。ICT教材による学習支援と心のケアを提供する。学校との連携で出席認定も可能。
