あかつき指導会
横浜市青葉区の学習塾が母体のフリースクールコース。不登校の子を対象に学力に合わせた学習支援を中心に進め、通塾時間を自由に設定でき、来た日数に応じた月謝制で継続的なサポートと進路相談が可能。
NPO法人 箱崎自由学舎ESPERANZA（エスペランサ）
不登校・ひきこもり・進学/中退でお悩みの方を対象にした福岡市のフリースクール。教科指導、農業体験、料理教室、陶芸体験など多彩な活動を実施する。
COMETセミナー
不登校対応の学びの場。ICT教材と紙学習を併用し、教育カウンセラーが常駐。50年以上の歴史ある提携塾と連携した進学支援。
学び舎あとらぼ（熊本サドベリースクール）
サドベリースクール方式のオルタナティブスクール／フリースクール。ミーティング（会議）で運営方針を決め、遊びを学びと捉え、自由参加型ワークショップや水曜の外出活動（そとらぼ・ここらぼ）を行う。2025年秋に新しいフリースクールへ生まれ変わり。運営者：山田朋和。
あおぞら教室（フリースクール今治）
学校に登校できていない子どもをサポートし、子ども・保護者・学校の橋渡しをしながら一人ひとりが自分らしく歩める道を一緒に探すフリースクール。2023年2月開室。
フリースクールたけのこ（株式会社KAGUYA）
子どもたちが安心して自分のままでいられる学びの場。不登校・ひきこもり・発達障害などの子どもを受け入れる。
キズキ共育塾
不登校・中退・通信制高校からの受験に対応する完全個別指導塾。14,000人以上の卒業生実績を持ち、小学生から社会人まで対象。心身の不調と学びの継続を並行してサポートする。
フリースクール S-BASE
学校に行きづらい子のパワーチャージと親子の絆をつなぐ居場所。家や学校以外の居場所を求める子を支援するフリースクール。
学VIVA（マナビバ）
塾でもフリースクールでもなく、子どもが自分で学び、自分で人生を選び歩き出す力を育てる場。元教職25年の実践から生まれた知行共育モデルを実践。遊び・対話・学習・探究の4つの基本活動を行う。
一般社団法人鈴 フリースクール
学習障害や発達障害などで学習や人間関係づくりが困難で学校に行けなくなった子をサポートするスクール。不登校・ひきこもり・軽度の発達障害を抱える子を受け入れ学びの場を提供する。