フリースクール大田シューレ
不登校の小中高生が安心して学べるフリースクール。自由を大切にし、子どもたちで活動を創り、互いの違いを尊重する場所。学習や進路相談、オンライン対応、保護者同伴通室にも対応する。
フリースクール青い空
フリースクール、不登校等の教育相談、森のがっこう（森のようちえん）、こども食堂「ハラクッチー」「地域ふれあい食堂」、地域交流活動「エール」などを実施。「ゆっくり休んでやりたいことをやる」自立支援。
フリースクール ネモ（NPO法人ネモ）
活動や学びありきではなく、自分の土台作りこそがフリースクールの活動・学習のスタート。
NIJINアカデミー青森十和田校
美術・創作に特化したリアル教室。絵画(デッサン・パステル・水彩・アクリル)・立体制作・ものづくりに対応。年1～2回の作品展、十和田市現代美術館訪問、月1回程度のクッキングタイム。オンライン＋リアルのハイブリッド通学。定員6名。
フリースクール にじっこ（NPO法人 好きと生きる）
不登校の子どもや生きづらさを抱える若者に安心できる居場所を提供。各地で「にじっこ」「おかえり」という居場所を開催。
特定非営利活動法人 越谷らるご（フリースクール りんごの木／不登校・ひきこもり 親の会）
NPO法人越谷らるごが運営。フリースクール りんごの木（子どもの思いを大切にし自主的に決める）、埼玉県ひきこもり相談サポートセンター、親の会（月1回程度）、ほっとりんご（20歳以上の居場所）。自立援助ホーム「ゆらい」（15～20歳）も併設。
NPO法人クリエイト（クリエイト インターナショナル クリスチャン スクール）
全日制の小中高一貫校。少人数で個々の能力・個性に合わせた学習指導。心理カウンセリングも対応。聖書を中心とした教育。
飯山学習センター（NPO法人ぱーむぼいす運営）
悩みを抱える高校生の学習・生活支援を行い、さくら国際高校と連携して高校卒業を目指す生徒の支援も行う。
あかつき指導会
横浜市青葉区の学習塾が母体のフリースクールコース。不登校の子を対象に学力に合わせた学習支援を中心に進め、通塾時間を自由に設定でき、来た日数に応じた月謝制で継続的なサポートと進路相談が可能。
TSUKUBA 学びの杜学園
いじめ・不登校・ひきこもり・障がい等で学校に行けなくなった子供たちが、生きる力をゆっくりと身につけることをめざすフリースクール。