ひふみ学園
岐阜県恵那市岩村に拠点を置く小中学生向けのオルタナティブスクール。グローカルな人材育成を教育理念に、起業家教育・職人教育を含むキャリア教育に注力。自由進度学習、自然体験、プログラミング・アート、探究学習、心のケア、キャリア教育を実施。
大田シューレ
東京都大田区で活動するフリースクール。不登校の小中高生が安心して学び成長できる場所として、自由と違いの尊重を大切にし、子どもが自分で決めることをサポートする。
ito（いと）
不登校の小中学生を対象としたフリースクール。個性を尊重した学習環境で、体を動かしたり料理やゲームなど好きなことを実践。フリースペースも週1回程度開催し、相談も随時受け付ける。
フリースクール ネモ市川（NPO法人ネモ）
NPO法人ネモネット運営の子ども・若者の居場所。小中高生を中心に20〜30代も利用。決まった時間割やプログラムはほぼなく、月数回のミーティングで活動を決め、自由に過ごせる。
家族と教育を考える会（K4）／フリースクール実光塾
駅家セラピールーム（心理カウンセリング）、実光塾（フリースクール/学習支援）、福山ACミーティング（自助グループ）を運営。不登校・ひきこもり当事者および保護者を支援。
ワイズアカデミー 目黒キャンパス
目黒駅から徒歩3分にある中学生のためのフリースクール。毎月自由参加のイベントあり。中高一貫でサポート。
アンダンテの会 南丹・京丹波
同じ経験をした親どうしが話を聞き合い情報交換をする場。親がホッとできる「ココロの居場所」づくりを進めている。
セカンドスペーストゥエンデ
地域・社会・世界とつながりながら子どもの健やかな心の育成を応援するフリースクール。
フリースクール空（そら）
滋賀県守山市にある、登校拒否の小・中・高生のための生活・学びの場。少人数で元小・中学校教師が在籍。論語とそろばんを学ぶ。
認定NPO法人 夢街道国際交流子ども館
京都府木津川市でフリースクールを運営する認定NPO法人。不登校や引きこもり経験など様々な背景を持つ小学4年生から高校生を対象に、「信じる・待つ・愛する」をモットーに子どもが素顔のまま過ごせる場所を提供する。
