不登校・ひきこもり相談支援センター こまどぷらす／KOMADO STREET（NPO法人まど運営）
不登校・ひきこもり相談支援センターの業務を新施設にて継続実施。多機能型施設による切れ目ない支援。
特定非営利活動法人 みんなの教室
「子どもたちの居場所をつくる」ことと「一人ひとりに寄り添い一緒に学び成長する」ことを理念に、自分の『好きなこと』『やりたいこと』を軸に活動にチャレンジする場所。
星の会
不登校・ひきこもりで悩む、親と支援者の「心の居場所」。親の会（例会）、手記掲載、コラム発信、講演会・イベント開催を行う。
ここのね自由な学校（認定NPO法人ここのね）
認定NPO法人ここのねが運営するオルタナティブスクール／フリースクール。「自ら学びたい」という内発的動機を大切にする。全日制・選べる通学型・おしえない学校（月1土曜）。
不登校を考える親の会「空の会」
同じ立場の親たちが互いに体験を交流しながら子どもや不登校についての理解を深める親の会。中学卒業後や社会進出後の相談、関連機関へのつなぎも行う。不登校・ひきこもりで悩む親と支援者の「心の居場所」。
モルゲンシュテルン（風の谷）／国東教育共同体
国東市国東町下成仏699にあるシュタイナー教育を基盤としたフリースクール。ファームコミュニティー（共同体）としての学び、放課後等デイサービス・児童発達支援なども運営。
別府フリースクールうかりゆハウス
フリースクール（不登校児童対象）、個別学習塾（外国籍児童・学習困難児向け）、こども哲学対話の3つの軸で運営。2022年4月開設。
不登校専門の個別指導・通信制サポート校／株式会社ティエラコム
自立教育を実践し、西日本を中心に小中高一貫の教育ネットワークを構築する教育企業。教育事業(能力開発センター、山本塾、東進衛星予備校等)とグローバル教育事業を展開する。
おおいたうさフリースクール夢の星
自分の価値に気づき、自分を好きになるための教育機関を目指すフリースクール。多彩な体験学習や特別講座を提供。さくら国際高等学校宇佐キャンパスと併設。
コスモス
コスモス。由布市が設置する公的な教育支援センター（適応指導教室）。由布市に在住・在籍で不登校の小・中学生が対象で授業料無料。少人数で学習・活動・教育相談を行う。
